木糖葡萄球菌的多位点序列分型分析
黔南民族师范学院, 生物科学与农学院, 贵州都匀 558000
| 摘 要： | 【目的】为了探究木糖葡萄球菌的亲缘远近和遗传进化关系，以期为木糖葡萄球菌的快速检测和鉴定提供基础。【方法】本论文以下载自NCBI的所有木糖葡萄球菌的全部菌株为研究对象，基于8个持家基因（arcC、bglA、dnaJ、groL、purA、pyrD、recA和tpiA）创建了一个多位点序列分型（Multi-locussequencetyping, MLST）流程，进行多位点序列分析。【结果】结果表明，所创建的MLST方法能较好的对木糖葡萄球菌进行分型分析，其中纳入分析的72株木糖葡萄球菌可以归类为53个ST型，进而被划分为3个亚群。另外，所选的8个持家基因中arcC和recA显著发生了基因重组。【结论】总之，建立的多位点分型方法能够用于木糖葡萄球菌的遗传进化分析。 |
| 关 键 词： | 木糖葡萄球菌; 多位点序列分型; 持家基因; 群体结构; 重组分析 |
| DOI： | 10.57237/j.life.2025.02.001 |
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收稿日期: 2025-11-17
接受日期: 2025-12-15
在线出版日期: 2025-12-24
Multilocus Sequence Typing Analysis of Staphylococcus xylosus
School of Biological Scienceand Agriculture, Qiannan Normal University for Nationalities, Duyun 558000, China
| Abstract: | Objective: In order to explore the genetic distance and evolutionary relationship of Staphylococcus xylosus, and to provide a basis for rapid detection and identification of Staphylococcus xylosus. Method: This paper focuses on all strains of Staphylococcus xylosus downloaded from NCBI as the research object. Based on 8 housekeeping genes (arcC, bglA, dnaJ, groL, purA, pyrD, recA, and tpiA), a multilocus sequence typing (MLST) process was created for Multilocus sequence analysis. Result: The results indicate that the MLST method created can effectively perform typing analysis on Staphylococcus xylosus. Among them, the 72 strains of Staphylococcus xylosus included in the analysis can be classified into 53 ST types, which can be further divided into 3 subgroups. In addition, among the 8 selected housekeeping genes, arcC and recA underwent significant genetic recombination. Conclusion: In summary, the established MLST method can be used for genetic evolution analysis of Staphylococcus xylosus. |
| Keywords: | Staphylococcus xylosus; Multilocus Sequence Typing; Household Genes; Group Structure; Recombination Analysis |
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